就叶氏所用方药来看，叶氏全面的继承了历代医家的主要辨治方法，其所用方剂数量甚多。大凡前人的重要方剂，叶氏都能信手拈来并加减化裁，如从己出。仅就《指南医案》书后所附方剂列表观之，其用方范围，由经方至时方，涵盖了叶氏以前几乎所有中医流派的重要方剂。叶氏对于方剂的理解，每有精辟之论，如论《外台》茯苓饮：“胃虚益气而用人参，非半夏之辛，茯苓之淡，非通剂矣”，“人参辅胃开痞，扶胃有益”，“茯苓通胃阳”。又论补通并用之法，云：“《局方》大健脾丸、仲淳资生丸，多以补虚、通滞、芳香合用者，取其气通浊泄，人参补正之力得矣。”又如论人参用法，曰：“人参非助热之药，《本草》云：阴中之阳，其气主升。故不宜单用”。又论胃药与脾药之异，曰：“数年病伤不复，不饥不纳，九窍不和，都属胃病。阳土喜柔，偏恶刚燥，若四君、异功等，竟是治脾之药。”此言前医不知胃脾用药不同而投四君、异功以治胃病。又论治脾阳虚寒便血证云：“凡脾肾为柔脏，可受刚药；心肝为刚脏，可受柔药，不可不知。（罗）谦甫治此症，立法以平胃散作主，加桂、附、干姜、归、芍，重加炒地榆以收下湿，用治神效，即此意也。”此类论述，均能启迪心智，切合临床。
由于对于方剂适应证的深刻理解，许多为常人所忽视的方剂，在叶氏医案中，实际上都有了“证型”的意义。通过对叶案方剂用法的学习，可以使我们对于这些“证型”，有一个清晰、完整的概念，从而达到胸有成竹、熟练运用的目的。
值得注意的，是叶氏对于经方的使用范围十分宽广。与传统经方家的墨守成规不同，叶氏对于经方的化裁加减，十分灵活，穷极变化，曲尽其妙。这也是对于经方深刻理解的结果。仅仅因为叶氏在温热病治疗方面的贡献，掩盖了其他方面的成就，致使后人往往忽视了叶氏在经方应用方面的精彩内容。
除人所共知的叶案温热诸治法外，今人应作为专题学习者，尚有：
经方，如桂枝汤、大小建中汤、大小青龙汤、苓桂味甘汤、茯苓甘草汤、苓桂术甘汤、肾气丸、都气丸、理中汤、真武汤、乌头汤等均应作重点分类研究。
脾胃治法。在叶案中尤为丰富，类方甚多，不一一列举。
络病论治。
辛香流气法。此由前人成方经过叶氏发展而为一种证型。
虎潜丸法即刚柔配伍温补肝肾法，亦由前人成方发展为一证型者。
介类潜阳法。
虫类搜剔法。
奇经八脉论治。
通过对于叶天士医案的初步研究，笔者认为，叶氏各种传世医案，均能反映其理法方药论治方面的基本特点，只是各本方论有繁简的不同而已。而有些独具特点的论治方法，又往往非后来学者所能了解且非浅学所能随意伪造者。因而所谓“《指南医案》本身是伪书，续出者更是伪上加伪”的说法，显然是不能成立的。
